تالاب بین‌المللی چغاخور و اراضي حاشيه آن، با مختصات جغرافيايي 31 درجه و 54 دقيقه تا 31 درجه و 56 دقيقه عرض شمالي و 50 درجه و 52 دقيقه تا 50 درجه و 56 دقیقه‌ی طول شرقي در قسمت شرق استان چهارمحال و بختياري و در 60 کيلومتري جنوب شهرکرد (مركز استان) واقع گردیده است. حوضه آبريز اين تالاب بين عرض جغرافيايي 31 درجه و 50 دقيقه و 48/13 ثانيه تا 31 درجه و 57 دقيقه و 14/9 ثانيه عرض شمالي و طول 50 درجه و 48 دقيقه و 25/21 ثانيه تا 50 درجه و 57 دقيقه و 12/26 ثانيه طول شرقي و از شمال تا جنوب شرقي تالاب کشیده شده است. در يک نگاه کلي فرم توپوگرافي درياچه و اراضي اطراف آن به گونه‌اي است که چاله و دشت ميانه کوهي را ايجاد کرده و ارتفاعات بر آفتاب در شمال، شاپورناز در غرب و کلار در جنوب دورتادور آن را احاطه کرده‌اند. خط‌الرأس اين ارتفاعات حوضه‌ آبریز چغاخور را شکل می‌دهد. اين ارتفاعات در ناحيه کوهستاني زاگرس واقع گرديده و درنتیجه فعالیت‌های تکتونيکي شکل‌گرفته‌اند و تقریباً تمامي جهات اطراف درياچه را محاصره کرده‌اند.